★1990年 日本都市センターで設立総会を開催し、3月31日付けで本学会が発足。初代会長に本好茂一氏を選出し、事務局を東京都世田谷区弦巻のJRA競走馬総合研究所内に設置。
第1回学術集会をJRA馬事公苑で開催(11月)。
「Japanese Journal of Equine Science(JJES)」を刊行。
★1994年 JJESを競走馬総合研究所の「Bullten of Equine Reseach Insutitute」と統合し、「Journal of Equine Science(JES)」に改称。
JRA競走馬総合研究所の「馬の科学」をJESとの交換雑誌として会員へ配布開始。
★1994年 第7回国際馬伝染病会議(東京、6月)を後援。
★1995年 JES特別号を刊行(年1または2回)。
世界獣医学大会(横浜、9月)のウマ分科会を共催。
★1997年 競走馬総合研究所の移転に伴い、事務局を栃木県宇都宮市砥上町に移転(2月)。
★1998年 JES特別号に代る和文雑誌として「Hippophile」を刊行。
第5回国際馬運動生理会議を競走馬総合研究所と共催(9月)。
★2000年 活性化推進委員会を設置。本学会ホームページを開設。
創立10周年記念事業として特別講演、特別表彰、ウマ用語集の編纂等を実施。
★2001年 事務局長ポストの新設。2代目会長に上原伸美氏を選出。
国際交流促進事業「学術渡航支援事業」を開始。
★2002年 広報担当常任理事の新設。
会計年度の変更(11月1日〜翌年10月31日まで)。
★2003年 定時総会および学術集会の開催時期を春期から冬期に変更。
★2004年 ウマの用語集2003(英和・和英)の発行。
本年度から学術集会は東京大学で開催。
★2005年 Hippophileヒポファイルの表紙を「騎手(The Jockey)
:アンリ・ド・トゥールーズ=ロートレック」に変更。
3代目会長に小川 諄氏を選出(11月)。
★2008年 学術集会をJRAの「競走馬に関する調査研究発表会」と
連続で開催し、共催で合同シンポジウム「トップアスリートとしての競走馬」を開催。
★2009年 馬臨床獣医師ワーキンググループが発足。
★2010年 WEVA特別講演を第23回学術集会にて開催
★2011年 4代目会長に菅野 茂氏を選出(11月)。